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上海大學Mark Waller教授利用人工智能將化學合成路線設計速度提高30倍
2018-04-12  來源:中國聚合物網(wǎng)

  上海大學量子與分子結構國際中心(ICQMS)、物理系東方學者Mark Waller教授,近日在國際頂級期刊Nature上發(fā)表了以上海大學為通訊作者單位的研究論文“Planning chemical syntheses with deep neural networks and symbolic AI”。該團隊應用深層神經(jīng)網(wǎng)絡及人工智能算法,來規(guī)劃新的化學合成路線。

  傳統(tǒng)的化學合成路線設計一般采用被稱為“逆合成分析”的策略,把要合成的復雜目標分子拆分成若干小分子前體,對前體再拆分,不斷進行,直到達到實驗室已有的化合物為止。Mark Waller教授應用計算機來輔助逆合成分析,開發(fā)了新的計算預測系統(tǒng)。該系統(tǒng)采用蒙特卡洛樹進行搜索,并引入符號人工智能來尋找逆合成分析的路線。并且,在蒙特卡洛樹步驟還中引入了兩種深度神經(jīng)網(wǎng)絡來提高計算精度與效率:擴張決策網(wǎng)絡用于尋找路徑,過濾網(wǎng)絡用于對可能的逆合成路線進行初步篩選。用于訓練神經(jīng)網(wǎng)絡的測試集包括了所有已經(jīng)發(fā)表過的有機化學反應。

和兩種傳統(tǒng)合成方法相比(紅色和綠色),使用新型人工智能算法(藍色)在較短時限內可以完成更多分子的合成路線預測(圖片來源:《Nature》)

  經(jīng)測試,Mark Waller教授開發(fā)出的分析系統(tǒng)比傳統(tǒng)的計算機輔助法快30倍,預測出的合成路線比傳統(tǒng)計算機輔助法給出的多一倍,還不需要任何其他的經(jīng)驗或者假設。

  Mark Waller教授開發(fā)的逆合成分析系統(tǒng)的結果具有很高的專業(yè)水平,在一個雙盲的AB測試中,大部分接受測試的化學家都認為,分析系統(tǒng)生成的合成路線是與已經(jīng)發(fā)表的文獻等價的。 

  “在過去的60年里,科學家們一直試圖通過人工編碼的方式,將合成規(guī)則指定給計算機,”Waller博士在論文中寫道:“和傳統(tǒng)方法不同的是,我們使用了具備規(guī)劃能力、符號象征能力及自動化學習能力的強大算法,這對于計算機能否在化學合成中發(fā)揮輔助作用至關重要。而這一技術也為滿足人類在農(nóng)業(yè)、醫(yī)療及材料科學等領域的需求奠定了堅實的基礎!

  隨著人工智能技術的不斷發(fā)展,其已經(jīng)開始在化學合成領域發(fā)揮強大的作用。我們也希望,未來的人工智能可以在更加多樣的科研領域內,實現(xiàn)越來越多的突破。

  原文鏈接:https://www.nature.com/articles/nature25978 

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(責任編輯:xu)
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